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Ebola Virus Computational Resources (EbolaVCR) is the in silico resources developed to facilitate scientific community fighting against deadly virus EBOLA. This server enlists possible vaccine candidates, therapeutic siRNAs and other related resources.
Reference: Dhanda et. al. (2016) A web-based resource for designing therapeutics against Ebola Virus. Sci Rep. 6:24782.
AntigenVP24
StrainReston Ebola Virus (RESTV)
Number of strain5
Gene IDgi_22789228
Protein IDNP_690586.1
Mapped EpitopeVisualize
Sequence conservationVisualize Alignment
IDstartPeptideCTLMHC I allelesMHC I allele CountHLA allelesHLA allele Count MHC II allelesMHC II allele CountB cell epitopeInterferon-gamma inducerInterleukin-4 stimulator
8337Reston Ebola Virus (RESTV)29 FLITQTLQG NHLA-A2.1, HLA-B*51, HLA-B*54013NA0DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_010530N0.09
8399Reston Ebola Virus (RESTV)91 IWALRVILA NHLA-B*51, HLA-B*53012NA0DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_13116N0.86
8387Reston Ebola Virus (RESTV)79 LFQNPNSVI NHLA-A24, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5201, HLA-B*5301, HLA-Cw*0401, MHC-Kd, MHC-Kk8NA0DRB1_0401, DRB1_04212N0.36
8475Reston Ebola Virus (RESTV)167 LHVVNYNGL NHLA-B*3801, HLA-B*3901, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-Cw*0301, MHC-Db, MHC-Db revised, MHC-Kb8NA0DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_15063N0.19
8434Reston Ebola Virus (RESTV)126 LLTTTSTHF NHLA-A2.1, HLA-A3, HLA-B*2702, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B62, MHC-Ld7NA0DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_07033N0.99
8343Reston Ebola Virus (RESTV)35 LQGWKVYWA NHLA-A*0201, HLA-B*2702, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B625NA0DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_132818N0.40
8402Reston Ebola Virus (RESTV)94 LRVILAAGL NHLA-B14, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*3901, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-Cw*0301, HLA-Cw*06029NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_010533N0.80
8362Reston Ebola Virus (RESTV)54 MALLTRLKT NHLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*58014NA0DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_150611N0.05
8329Reston Ebola Virus (RESTV)21 VIFSDLCNF NHLA-A3, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B62, MHC-Ld8NA0DRB1_0301, DRB1_03092N0.28
8404Reston Ebola Virus (RESTV)96 VILAAGLQD NNA0NA0DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_13213N0.65
8394Reston Ebola Virus (RESTV)86 VIQSPIWAL NHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2, HLA-A2.1, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B7, HLA-Cw*0401, MHC-Dd, MHC-Kb11NA0DRB1_0701, DRB1_07032N0.34
8478Reston Ebola Virus (RESTV)170 VNYNGLLSS NNA0NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_150633N0.18
8477Reston Ebola Virus (RESTV)169 VVNYNGLLS NMHC-Db revised1NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_150636N0.23
8400Reston Ebola Virus (RESTV)92 WALRVILAA YHLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B*5801, HLA-B618HLA-B*0702, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*0110DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_132316N0.80
8480Reston Ebola Virus (RESTV)172 YNGLLSSIE NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_04214N0.02
8316Reston Ebola Virus (RESTV)8 YNLVPPKKD NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_0405, DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_01056N0.99